上海海事大學是一所以航運、物流、海洋為特色，具有工學、管理學、經濟學、法學、文學、理學和藝術學等學科門類的多科性應用研究型大學。2008年，上海市人民政府與交通運輸部簽訂協(xié)議，共建上海海事大學。2018年，學校納入上海市高水平地方高校建設。

上海海事大學設有3個博士后科研流動站（交通運輸工程、電氣工程、管理科學與工程），4個一級學科博士點（交通運輸工程、管理科學工程、船舶與海洋工程、電氣工程），17個二級學科博士點，17個一級學科碩士學位授權點，64個二級學科碩士學位授權點，13個專業(yè)學位授權類別，52個本科專業(yè)。擁有19個省部級重點研究基地。現(xiàn)有1個國家重點（培育）學科，1個上海市高峰學科，2個上海市高原學科，9個部市級重點學科，工程學、計算機科學、社會科學總論和材料科學4個學科進入ESI全球前1%，港航物流學科保持全球領先。5個國家級特色專業(yè)，1個國家級綜合改革試點專業(yè)，15個國家級一流本科專業(yè)建設點，6個教育部卓越工程師教育培養(yǎng)計劃專業(yè)，17個上海市本科教育高地?，F(xiàn)有2個國家級實驗教學示范中心，2個國家級虛擬仿真實驗教學示范中心，5個國家級實踐教學示范中心，1個全國示范性工程專業(yè)學位研究生聯(lián)合培養(yǎng)基地。設有水上訓練中心，擁有4.8萬噸散貨教學實習船“育明”輪。

在2004年教育部本科教學工作水平評估和2006年教育部英語專業(yè)教學評估中獲得優(yōu)秀。近年來，科技服務能力不斷提升，獲一批國家級科研項目及部市級以上科技進步獎。

實行校院二級管理體制，現(xiàn)設有商船學院、交通運輸學院、經濟管理學院（上海高級國際航運學院、亞洲郵輪學院）、物流工程學院（中荷機電工程學院）、法學院、信息工程學院、外國語學院、海洋科學與工程學院、理學院、徐悲鴻藝術學院、馬克思主義學院、物流科學與工程研究院、體育教學部、國際教育學院、繼續(xù)教育學院、上海港灣學校等二級辦學部門。在27000余名學生中，有全日制本科生16000余人，各類在校研究生近8000人，留學生900余人。在近1300名專任教師中，有教授190余名。學校致力于培養(yǎng)國家航運業(yè)所需要的各級各類專門人才，已向全球港航業(yè)單位、政府機構輸送了逾20萬名畢業(yè)生，被譽為“高級航運人才的搖籃”。

上海海事大學2013年成立中國（上海）自貿區(qū)供應鏈研究院和上海高級國際航運學院。中國（上海）自貿區(qū)供應鏈研究院將自貿區(qū)建設與供應鏈研究有機結合，以提升自貿區(qū)產業(yè)鏈建設水平，促進自貿區(qū)貨物貿易向服務貿易的轉型發(fā)展，同時推動政府監(jiān)管職能的轉變。上海高級國際航運學院采取國際上先進的商學院運作模式，與全球優(yōu)秀教育機構資源共享，著力打造國內領先、國際知名的航運金融教育品牌，構筑具有影響力的航運高端人才輸出基地。

2008年，上海市教育委員會、上海市城鄉(xiāng)建設和交通委員會、上海海事大學、虹口區(qū)人民政府等20多家單位共同發(fā)起成立上海國際航運研究中心。中心掛靠上海海事大學，是國際航運業(yè)發(fā)展的研究和咨詢機構，為政府和國內外企業(yè)與航運機構等提供決策咨詢和信息服務，是上海市教委首批建立的“高校知識服務平臺”之一。 2014年，市教委將該平臺掛牌為“上海市協(xié)同創(chuàng)新中心”。